MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187125	GGC	2	6	24	29	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187125	AGC	2	6	133	138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187125	AAC	3	9	216	224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247803
4	NT_187125	GCA	2	6	238	243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247803
5	NT_187125	GAAG	2	8	281	288	50 %	0 %	50 %	0 %	409247803
6	NT_187125	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247803
7	NT_187125	ACA	3	9	432	440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247803
8	NT_187125	CGG	2	6	591	596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247803
9	NT_187125	TCG	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247803
10	NT_187125	CAC	2	6	781	786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247803
11	NT_187125	T	6	6	827	832	0 %	100 %	0 %	0 %	409247803
12	NT_187125	CGC	2	6	891	896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247803
13	NT_187125	GGC	2	6	928	933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247803
14	NT_187125	GGCT	2	8	935	942	0 %	25 %	50 %	25 %	409247803
15	NT_187125	GGC	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247803
16	NT_187125	ATG	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247803
17	NT_187125	TGG	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247803
18	NT_187125	CAT	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247803
19	NT_187125	CTGG	2	8	1099	1106	0 %	25 %	50 %	25 %	409247803
20	NT_187125	GGTC	2	8	1127	1134	0 %	25 %	50 %	25 %	409247803
21	NT_187125	TAC	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247804
22	NT_187125	ACT	2	6	1200	1205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247804
23	NT_187125	CG	3	6	1261	1266	0 %	0 %	50 %	50 %	409247804
24	NT_187125	TAA	2	6	1272	1277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247804
25	NT_187125	GTC	2	6	1514	1519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247804
26	NT_187125	GCG	2	6	1594	1599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247804
27	NT_187125	TGC	2	6	1643	1648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247804
28	NT_187125	AGA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247804
29	NT_187125	GGAT	2	8	1828	1835	25 %	25 %	50 %	0 %	409247804
30	NT_187125	TGC	2	6	1905	1910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247804
31	NT_187125	AAG	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247804
32	NT_187125	A	6	6	1960	1965	100 %	0 %	0 %	0 %	409247804
33	NT_187125	ATT	2	6	1999	2004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247804
34	NT_187125	ATT	2	6	2055	2060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247804
35	NT_187125	A	6	6	2129	2134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187125	T	6	6	2153	2158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187125	ATA	2	6	2211	2216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247805
38	NT_187125	TTTC	2	8	2272	2279	0 %	75 %	0 %	25 %	409247805
39	NT_187125	CTT	3	9	2305	2313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247805
40	NT_187125	GAA	2	6	2404	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247805
41	NT_187125	TTC	2	6	2411	2416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247805
42	NT_187125	ATG	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247805
43	NT_187125	AT	3	6	2527	2532	50 %	50 %	0 %	0 %	409247805
44	NT_187125	TTC	2	6	2682	2687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247805
45	NT_187125	GGA	2	6	2722	2727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247805
46	NT_187125	CGG	2	6	2754	2759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247805
47	NT_187125	TGA	2	6	2839	2844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247805
48	NT_187125	GAC	2	6	2896	2901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247805
49	NT_187125	GA	3	6	2937	2942	50 %	0 %	50 %	0 %	409247805
50	NT_187125	AT	3	6	2948	2953	50 %	50 %	0 %	0 %	409247805
51	NT_187125	CTT	2	6	2962	2967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247805
52	NT_187125	GCT	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187125	AGG	2	6	3216	3221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187125	AAT	2	6	3241	3246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187125	A	6	6	3250	3255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187125	AGA	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NT_187125	CGT	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187125	CGGT	2	8	3364	3371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NT_187125	CT	3	6	3391	3396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NT_187125	T	6	6	3463	3468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187125	GC	3	6	3500	3505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NT_187125	GTAG	2	8	3528	3535	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NT_187125	CAC	2	6	3674	3679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NT_187125	CG	3	6	3690	3695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187125	AG	3	6	3740	3745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187125	TC	3	6	3748	3753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NT_187125	TGA	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187125	CAC	2	6	3950	3955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NT_187125	TCCT	2	8	3964	3971	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NT_187125	TCT	2	6	3979	3984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187125	TTA	2	6	3987	3992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187125	CAA	2	6	3998	4003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187125	AAC	2	6	4144	4149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NT_187125	TAC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NT_187125	CGG	2	6	4189	4194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NT_187125	GAA	2	6	4232	4237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187125	TGC	2	6	4354	4359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187125	GTT	2	6	4382	4387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187125	CTG	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187125	GTC	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NT_187125	CAT	2	6	4459	4464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NT_187125	TGA	2	6	4492	4497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187125	GCT	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187125	GAC	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187125	TCGT	2	8	4578	4585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NT_187125	ATC	2	6	4634	4639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NT_187125	CTGG	2	8	4643	4650	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.